Написанное ниже относится к версиям MikroBILL 2.0.6 и более новым.
Для создания расширений на PHP вам понадобится подключить файл apicore.php
(найти его можно в папке WEB документов апача в подпапке kassa).
Полное описание классов доступно здесь.
Версия класса для Python здесь.

//Импортируем библиотеку API
include 'apicore.php';

//Создаём новый экземпляр класса MikroBILL_API
$Api = new MikroBILL_API('IP_или_host', Port, 'Login', 'Password');

//Выполняем запрос API
$Api->Process('Команда API');

//Закрываем соединение
$Api->Close();

Команды вызываются по их пути. Разделителем пути является символ точки. Путь соответсвует классам в их иерархии, описание классов доступно здесь.
Как видим, команда получения или поиска абонентов находится непосредственно в классе API, значит вызов будет выглядеть так:

$Api->Process('API.GetClients');

Результатом будет JSON вида:

{"return":[...], "code":0}

В поле return массив ID абонентов. Поле code = 0 показывает отсутствие ошибок. Любое другое число сигнализирует о проблеме, тогда в return будет описание.
Чтобы обратиться к свойству абонента, в пути команды необходимо указать ID абонета:

// Получаем имя абонента
$Api->Process("API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Name");

Результат:

{"return":"UserName", "code":0}

Ещё пример. Установим новый IP абоненту. Для этого нужно вначале получить все аккаунты абонента:

$Api->Process("API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Accounts");

Результатом будет массив GUID аккаунтов:

{"return":[...], "code":0}

Теперь обратимся к нужному аккаунту, чтобы получить свойство "IP".

$Api->Process("API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Accounts.$AccountGUID.IP");

Ответ:

{"return":"IP_клиента", "code":0}

Для установки значения необходимо добавить второй аргумент в функцию Process:

$Api->Process("API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Accounts.$AccountGUID.IP", "192.168.10.25");

Если функция требует несколько входящих аргументов, то их нужно передавать в виде массива.
Напоминаем, описание входных аргументов Вы можете найти в описании классов здесь.

// Добавляем аккаунт абоненту
$Api->Process("API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Accounts.AddAccount",["120.10.53.234","","Login","Password"]);

Если операция прошла успешно, вы получит сообщение вида:

{"return":"OK", "code":0}

Вы можете в одной команде запрашивать несколько значений (начиная с версии MikroBILL 2.0.9), для этого во второй аргумент в функцию Process необходимо передать массив.
В массиве необходимо перечислить аргументы так, чтобы начальный путь в функции Process + имя элемента массива образовали законченный путь.

// Создаём массив и перечисляем аргументы.
$arr = array((string)$AccountGUID => array('IP', 'MAC'));

// Выполняем команду
$Api->Process("API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Accounts", $arr);

// В данном случае будут вызваны 2 пути:
// API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Accounts.$AccountGUID.IP
// API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Accounts.$AccountGUID.MAC

Результатом будет JSON вида:

[{"return":"1.1.1.1", "code":0, "path":"API.Client.633824158637492.AutorizeInfo.Accounts.28236356495083.IP"},
{"return":"AA:AA:AA:AA:AA:AA", "code":0, "path":"API.Client.633824158637492.AutorizeInfo.Accounts.28236356495083.MAC"}]

Для того, чтобы установить несколько параметров одновременно, нужно в массиве к каждому аргументу добавить ассоциированное значение.

// Создаём массив и перечисляем аргументы.
$arr = array((string)$AccountGUID => array('IP' => '192.168.25.110', 'MAC' => 'aa:bb:cc:dd:ee:ff'));

// Выполняем команду
$Api->Process("API.Client.$ClientGUID.AutorizeInfo.Accounts", $arr);

Результатом будет JSON вида:

[{"return":"OK", "code":0, "path":"API.Client.633824158637492.AutorizeInfo.Accounts.28236356495083.IP"},
{"return":"OK", "code":0, "path":"API.Client.633824158637492.AutorizeInfo.Accounts.28236356495083.MAC"}]

Так же имеется возможность в одной команде читать параметры и устанавливать.

// Создаём массив и перечисляем аргументы.
$arr = array((string)"$ClientGUID.BillingInfo.Money", (string)"$ClientGUID2.AutorizeInfo.Accounts.$AccountGUID2" => array('MAC' => 'aa:bb:cc:dd:ee:ff'));

// Выполняем команду
$Api->Process("API.Client", $arr);

Результатом будет JSON вида:

[{"return":"100.01", "code":0, "path":"API.Client.633824158637492.BillingInfo.Money"},
{"return":"OK", "code":0, "path":"API.Client.9527563927532953.AutorizeInfo.Accounts.835354904534456.MAC"}]

Вы можете использовать массивы с любой глубиной вложенности.
Например, здесь:

// Создаём массив и перечисляем аргументы.
$arr=array('IP' => '192.168.25.110');

// Выполняем команду
$Api->Process("API.Client.633824158637492.AutorizeInfo.Accounts.28236356495083", $arr);

И здесь:

// Создаём массив и перечисляем аргументы.
$arr = array('AutorizeInfo' => array('Accounts' => array('28236356495083' => array('IP' => '192.168.25.110'))));

// Выполняем команду
$Api->Process("API.Client.633824158637492", $arr);

В обоих случаях вызывается путь:
API.Client.633824158637492.AutorizeInfo.Accounts.28236356495083.IP